Os inibidores da PP2B-Aα compreendem uma gama diversificada de compostos que influenciam indiretamente a atividade da PP2B-Aα, principalmente através da modulação da sinalização do cálcio e das interacções com a calmodulina, que são cruciais para a ativação da calcineurina. Estes inibidores não visam diretamente a PP2B-Aα; em vez disso, exercem os seus efeitos em processos celulares e vias de sinalização relacionados. Os compostos como a ciclosporina A e o FK506 (tacrolimus) são exemplos clássicos de inibidores indirectos da PP2B-Aα. Funcionam através da formação de complexos com imunofilinas (ciclofilina e FKBP12, respetivamente), que depois inibem a calcineurina. Esta inibição bloqueia eficazmente a atividade fosfatásica da PP2B-Aα. Do mesmo modo, a trifluoperazina e o cloridrato de W-7, como antagonistas da calmodulina, perturbam o mecanismo de ativação da calcineurina pela calmodulina, inibindo assim indiretamente a PP2B-Aα.
Além disso, os bloqueadores dos canais de cálcio, como o verapamil, a nifedipina, o diltiazem e a amlodipina, inibem indiretamente a PP2B-Aα ao reduzir o influxo de cálcio. O cálcio é um ativador crítico da calcineurina e a redução dos níveis de cálcio intracelular pode, consequentemente, inibir as actividades de desfosforilação da PP2B-Aα mediadas pela calcineurina. A fenilefrina, ao modular a sinalização do cálcio através dos receptores alfa-1 adrenérgicos, e o cloreto de lítio, através dos seus efeitos em múltiplas vias de sinalização, podem também influenciar indiretamente a atividade da PP2B-Aα.
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