Estes compostos não se ligam diretamente à PI3K, mas afectam a atividade da enzima através de vários mecanismos bioquímicos e moleculares. A Wortmannin e o LY294002, tradicionalmente conhecidos como inibidores da PI3K, podem causar uma ativação transitória paradoxal da PI3K em determinadas condições, possivelmente devido aos intrincados mecanismos de feedback nas redes de sinalização celular. Este fenómeno sublinha a complexidade da sinalização celular e os efeitos indirectos que os inibidores podem ter nas suas enzimas-alvo.
O resveratrol, a metformina, a berberina e o ribosídeo de nicotinamida actuam através da ativação da AMPK, um regulador-chave da homeostase energética celular, que tem efeitos a jusante na via PI3K/Akt, uma via crítica para a sobrevivência, proliferação e metabolismo das células. Os ácidos gordos ómega 3, como o EPA e o DHA, alteram a composição lipídica da membrana, o que pode afetar indiretamente a localização e a função da PI3K na membrana celular. Antioxidantes e fitoquímicos como a curcumina, a quercetina, o EGCG e o sulforafano modulam várias vias de sinalização, incluindo as que envolvem a PI3K. As suas acções são diversas, desde a influência nas respostas ao stress oxidativo até à modulação da expressão genética e das actividades enzimáticas. A cafeína, um estimulante bem conhecido, tem impacto em várias vias de sinalização e pode ter um efeito indireto na atividade da PI3K, embora os seus mecanismos precisos neste contexto sejam menos claros.
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