O MRP-L38 é um componente integral do ribossoma mitocondrial, colocando-o no centro do processo de síntese proteica mitocondrial. No domínio dos produtos químicos que podem modular indiretamente a sua função, os inibidores visam em grande medida as operações mitocondriais. Por exemplo, a rotenona, a tenoiltrifluoroacetona, a antimicina A e o mixotiazol visam complexos distintos da cadeia de transporte de electrões. As perturbações neste complexo podem afetar a saúde e a eficiência globais das mitocôndrias, o que, por sua vez, pode afetar o MRP-L38.
Outros compostos, como a oligomicina A, a CCCP e a valinomicina, exercem os seus efeitos alterando a síntese de ATP ou o potencial da membrana mitocondrial. Estas alterações podem resultar numa alteração drástica do ambiente intramitocondrial, o que pode influenciar a estabilidade ou a função do MRP-L38. Por último, antibióticos como a tetraciclina, o cloranfenicol e a doxiciclina, conhecidos principalmente por terem como alvo os ribossomas bacterianos, podem também demonstrar efeitos no ribossoma mitocondrial devido à sua ascendência procariótica.
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