Os inibidores químicos da KIAA1009 incluem uma gama de compostos que afectam indiretamente a função da proteína, visando estruturas e processos celulares essenciais para a sua atividade. O monastrol, um conhecido inibidor da cinesina Eg5, interrompe a formação da bipolaridade do fuso, que é crucial para o funcionamento correto do centrossoma e das estruturas do fuso mitótico. Do mesmo modo, a S-Trityl-L-cisteína inibe seletivamente a Eg5, conduzindo a defeitos na montagem do fuso, influenciando assim o papel da KIAA1009 na estabilidade do centrossoma. Outro inibidor da Eg5, o Dimetilenastron, compromete a funcionalidade do aparelho do fuso associado ao centrossoma, afectando assim o KIAA1009. O ispinesib, ao inibir seletivamente a proteína do fuso da cinesina (KSP), prejudica a integridade da montagem do fuso, que é essencial para o papel desempenhado pelo KIAA1009 na função do centrossoma.
Além disso, produtos químicos como o Nocodazole e a Vinblastina actuam desestabilizando os microtúbulos, que são essenciais para a função do centrossoma e do fuso, interferindo assim com a atividade do KIAA1009. Em contrapartida, o Paclitaxel (Taxol) estabiliza os microtúbulos de tal forma que impede a instabilidade dinâmica necessária para a função do KIAA1009. A colchicina, ao impedir a polimerização da tubulina, perturba a organização dos microtúbulos e a função do fuso mitótico, afectando indiretamente os processos associados ao KIAA1009. O purvalanol A, um inibidor das cinases dependentes da ciclina (CDK), interrompe os processos de fosforilação dependentes das CDK, cruciais para a duplicação dos centrossomas e a montagem do fuso, afectando assim a função do KIAA1009. O ZM447439 e o BI 2536 têm como alvo a quinase Aurora e a quinase tipo Polo 1 (Plk1), respetivamente, ambas essenciais para a maturação e função do centrossoma. A sua inibição resulta na perturbação dos ciclos dos centrossomas e dos mecanismos de montagem do fuso, afectando a atividade do KIAA1009. Por último, o maribavir, embora seja conhecido principalmente por ter como alvo as cinases virais, também inibe as cinases celulares que podem afetar o estado de fosforilação das proteínas envolvidas na função do centrossoma, que é um aspeto fundamental do papel do KIAA1009 na célula.
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