Os inibidores químicos da IRX1 podem efetivamente impedir a sua função através de várias vias de sinalização celular que são críticas para o papel da proteína no desenvolvimento e manutenção das estruturas cardíacas. O Y-27632, um inibidor da proteína cinase associada à Rho (ROCK), interrompe a contração das células musculares lisas e a contratilidade da actomiosina, que são essenciais para a função adequada da IRX1 na formação do tecido cardíaco. Da mesma forma, o SB431542 tem como alvo o recetor ALK5 do TGF-β tipo I e, ao inibir este recetor, a via de sinalização do TGF-β é interrompida. Esta via é essencial para a diferenciação e morfogénese cardíaca, processos em que o IRX1 desempenha um papel crucial. Outro inibidor, o U0126, inibe seletivamente a MEK1/2, prejudicando a via MAPK/ERK. A inibição desta via pode levar à inibição funcional do IRX1, dado que o IRX1 está envolvido em vias de desenvolvimento reguladas pela sinalização MAPK/ERK.
Além disso, o LY294002 e a Wortmannin actuam como inibidores da PI3K, o que leva à interrupção da via de sinalização PI3K/Akt, uma via crítica para a proliferação e sobrevivência celular em que a IRX1 está implicada. A dorsomorfina e o LDN-193189, ao inibirem a AMPK e os receptores ALK2 e ALK3 das BMP de tipo I, respetivamente, interferem na sinalização das BMP, que é outra via crucial para os processos de desenvolvimento em que o IRX1 está envolvido. O SP600125, como inibidor da via da JNK, e o PP2, um inibidor da quinase da família Src, impedem as vias envolvidas em vários processos celulares, incluindo o desenvolvimento, levando potencialmente a uma inibição funcional do IRX1. Além disso, o SU5402 e o PD173074, como inibidores do FGFR, bloqueiam a sinalização do fator de crescimento dos fibroblastos, que é importante para os processos de desenvolvimento que envolvem o IRX1. A inibição destas vias pode interferir com o papel que o IRX1 desempenha nestes processos, levando à sua inibição funcional.
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