Os inibidores químicos da HEBP2 actuam através de várias vias bioquímicas para reduzir a atividade funcional da proteína. O alopurinol, ao inibir a xantina oxidase, reduz a produção de espécies reactivas de oxigénio, que podem ser fundamentais para as funções da HEBP2 relacionadas com o stress oxidativo. Do mesmo modo, a auranofina tem como alvo o estado redox celular, inibindo a tioredoxina redutase, o que poderia atenuar a atividade do HEBP2 que depende de mecanismos sensíveis ao redox. O papel da queleritrina como inibidor da proteína quinase C (PKC) sugere que pode reduzir a atividade do HEBP2 através da diminuição da fosforilação mediada pela PKC, enquanto o imatinib e o ortovanadato de sódio visam a atividade da proteína através da modulação da fosforilação da tirosina, com o imatinib a inibir certas tirosina quinases e o ortovanadato de sódio a inibir as tirosina fosfatases. Esta modulação da fosforilação pode alterar a função do HEBP2, uma vez que a sua atividade pode depender do estado exato da fosforilação.
Os inibidores da PI3K LY294002 e Wortmannin podem impedir a localização ou a atividade do HEBP2, impedindo os eventos de sinalização necessários para a sua função. A rapamicina, como inibidor da via mTOR, pode igualmente perturbar as vias essenciais para a atividade do HEBP2. A via MAPK/ERK é outro alvo, com U0126 e PD98059 ativados como inibidores de MAPK/ERK e MEK, respetivamente, potencialmente levando a uma diminuição da atividade de HEBP2. O SB203580 e o SP600125 também têm como alvo a via da MAPK, mas em nós diferentes; o SB203580 inibe especificamente a p38 MAP quinase e o SP600125 tem como alvo a c-Jun N-terminal quinase (JNK). Ao inibir estas cinases, ambos os produtos químicos podem diminuir os efeitos subsequentes que facilitam o papel do HEBP2 nas vias de resposta ao stress.
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