Os inibidores químicos da Galactose Mutarotase podem atuar através de vários mecanismos para impedir a sua função no metabolismo da galactose. A floretina, um fenol dihidrocalcona, perturba os transportadores de glicose e limita indiretamente a disponibilidade de substrato para a Galactose Mutarotase, reduzindo consequentemente a sua ação catalítica sobre a galactose. A quercetina e a fisetina, ambos flavonóides, apresentam uma inibição enzimática ao ligarem-se aos locais activos ou alostéricos da galactose-mutarotase, impedindo assim a enzima de interagir com o seu substrato, a galactose. O galato de epigalocatequina (EGCG), outra catequina potente, também tem como alvo os locais activos das enzimas, que incluem os da Galactose Mutarotase, impedindo a sua capacidade de catalisar a conversão da galactose. Além disso, o Kaempferol pode competir com a galactose na ligação à Galactose Mutarotase, inibindo efetivamente a função da enzima.
Além disso, sabe-se que a miricetina provoca a inibição funcional de várias enzimas, possivelmente induzindo alterações conformacionais na Galactose Mutarotase ou bloqueando o seu sítio ativo, o que interromperia a sua atividade enzimática na galactose. O resveratrol liga-se diretamente à Galactose Mutarotase, interferindo com a sua função catalítica. Da mesma forma, a rutina, um derivado glicosídico da quercetina, poderia inibir a enzima ligando-se a ela e impedindo a sua ação sobre a galactose. A silibina do cardo mariano pode também ligar-se à galactose mutarotase e inibi-la, perturbando o seu processo enzimático normal. O ácido tânico, com as suas propriedades de ligação às proteínas, actua ligando-se à Galactose Mutarotase, o que resulta na inibição da sua atividade sobre a galactose. A troglitazona, uma tiazolidinediona, pode interagir com a Galactose Mutarotase, alterando potencialmente a conformação da enzima. A genisteína, uma isoflavona que inibe as tirosina quinases, pode afetar indiretamente o estado de fosforilação da Galactose Mutarotase, influenciando assim a sua atividade enzimática.
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