Os inibidores químicos de GAGE podem exercer a sua influência através de vários mecanismos que afectam a estrutura da cromatina e os padrões de expressão dos genes nas células. O sulforafano e a tricostatina A, juntamente com o vorinostato, a romidepsina, o belinostato, o panobinostato, o SAHA, o entinostato, o ácido valpróico, o mocetinostato e a chidamida, são todos agentes que inibem a atividade das histonas desacetilases (HDAC). Ao fazê-lo, estes compostos podem induzir a hiperacetilação de histonas, levando a um estado de cromatina mais relaxado e aberto. Essa alteração na estrutura da cromatina pode facilitar ou dificultar o acesso da maquinaria transcricional ao DNA, resultando em mudanças na expressão de vários genes, incluindo aqueles que regulam a presença e a função do GAGE.
O dissulfiram, outro químico mencionado, actua através de um mecanismo diferente, inibindo a aldeído desidrogenase (ALDH), que desempenha um papel em vias celulares que se cruzam com as que envolvem o GAGE. A inibição da ALDH pelo dissulfiram pode levar a uma acumulação de aldeídos e a uma perturbação do equilíbrio do ácido retinóico, que é crucial para vários processos de diferenciação celular. Uma vez que a GAGE está implicada em certas vias celulares, os níveis alterados de aldeídos e de ácido retinóico podem afetar a atividade funcional desta proteína. Em geral, as acções destes inibidores químicos podem levar a uma diminuição da atividade funcional da GAGE, modificando o ambiente celular e influenciando as vias que governam o seu papel dentro da célula.
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