A forskolina destaca-se por ter o poder de elevar os níveis intracelulares de AMPc, um segundo mensageiro essencial que ativa a proteína quinase A (PKA). A ativação da PKA desencadeia uma cascata de fosforilação, que pode estender o seu alcance a uma proteína como a C9orf164, modificando a sua atividade. O PMA actua através da ativação da proteína quinase C (PKC). Esta quinase, um nó crítico em numerosas vias de sinalização, fosforila uma multiplicidade de substratos, com o potencial de incluir a C9orf164 se esta se encontrar na sua gama de proteínas-alvo. As acções inespecíficas do IBMX aumentam os níveis de AMPc e GMPc, prolongando e amplificando as acções da PKA e da PKG, respetivamente - quinases que poderiam fosforilar e ativar proteínas ao seu alcance.
Inibidores como SB431542, LY294002, PD98059, SP600125 e U0126, embora sejam conhecidos principalmente por impedir quinases específicas, podem modular indiretamente outros eixos de sinalização, através de mecanismos de feedback ou compensatórios, tendo assim o potencial de aumentar a atividade de uma proteína semelhante à C9orf164. A rapamicina, um inibidor seletivo da mTOR, orquestra uma redução da síntese proteica e da proliferação celular que, por sua vez, através de uma rede complexa de vias de sinalização, pode influenciar a atividade e a estabilidade de uma proteína como a C9orf164. A ativação da AMPK pelo AICAR funciona como um ponto de controlo metabólico, influenciando numerosos alvos a jusante, que incluiriam proteínas envolvidas na homeostase energética. O MG132 interrompe a via normal da ubiquitina-proteassoma, levando à acumulação de proteínas e, possivelmente, alterando a dinâmica funcional das proteínas, incluindo a C9orf164. A esturosporina, embora seja principalmente um inibidor, em concentrações subinibitórias pode ativar certas cinases, acrescentando outra camada de complexidade à regulação da atividade proteica.
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