O ANKRD33 pode influenciar a sua atividade através de vários mecanismos celulares. A forskolina, ao estimular diretamente a adenilil ciclase, eleva os níveis de AMPc na célula, que depois ativa a proteína quinase A (PKA). A PKA é conhecida por fosforilar resíduos de serina e treonina nas proteínas, e esta fosforilação pode ativar a ANKRD33. Do mesmo modo, o IBMX inibe as fosfodiesterases, conduzindo a uma acumulação de AMPc e à subsequente ativação da PKA, que, por sua vez, pode fosforilar o ANKRD33. O Dibutiril-CAMP, sendo um análogo do AMPc, penetra nas células e imita o processo natural de ativação da PKA, levando à fosforilação e subsequente ativação do ANKRD33.
Nas vias dependentes do AMPc, outras moléculas de sinalização também desempenham um papel na regulação do ANKRD33. O Fator de Crescimento Epidérmico (EGF) ativa o seu recetor, EGFR, e inicia uma cascata de eventos de sinalização a jusante, que podem incluir a ativação de ANKRD33 através de várias interacções proteína-proteína. A ativação da proteína quinase C (PKC) pelo 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA) pode levar à fosforilação da ANKRD33, uma vez que a PKC está envolvida na fosforilação de numerosos substratos celulares. O aumento dos níveis de cálcio intracelular, quer através da ação de ionóforos como a ionomicina e o A23187, quer através do inibidor da bomba SERCA, a tapsigargina, pode ativar as cinases dependentes da calmodulina (CaMK), que também podem ter como alvo a fosforilação do ANKRD33. A insulina ativa o recetor de insulina, desencadeando a via PI3K/Akt, onde a Akt pode fosforilar o ANKRD33. Por último, os inibidores das proteínas fosfatases, como o ácido ocadaico e a calicilina A, mantêm proteínas como a ANKRD33 num estado fosforilado, impedindo a sua desfosforilação, enquanto a anisomicina ativa as cinases activadas pelo stress, que podem fosforilar e ativar a ANKRD33, ligando-a à resposta ao stress celular
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