Os inibidores da PGC-1α englobam vários compostos que podem modular indiretamente a atividade da PGC-1α. Esta modulação ocorre através da influência noutras proteínas e vias de sinalização que interagem com a PGC-1α. Por exemplo, os activadores da AMPK, como o AICAR e a Metformina, podem fosforilar a PGC-1α, afectando as suas funções de coactivador transcricional. Os agonistas do PPAR, como o GW501516, o fenofibrato, a pioglitazona e a rosiglitazona, podem alterar os níveis de expressão e a atividade do PGC-1α, influenciando assim indiretamente as vias metabólicas em que o PGC-1α está envolvido.
Além disso, os activadores SIRT1, como o resveratrol, e os inibidores, como o EX-527, podem influenciar o estado de acetilação do PGC-1α, que é crucial para a sua atividade e interação com outros factores de transcrição. Esta modificação pós-traducional determina o papel da PGC-1α na biogénese mitocondrial e no metabolismo oxidativo. A modulação da atividade do PGC-1α por estes produtos químicos é significativa porque o PGC-1α é um núcleo regulador central do metabolismo energético, controlando a expressão de genes envolvidos na função mitocondrial, gluconeogénese e oxidação de ácidos gordos.
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