Plasmide CRISPR/Cas9 KO SREC (h): sc-406838

Présentation

SCARF1 code le récepteur scavenger exprimé par les cellules endothéliales (SREC), un récepteur scavenger de classe F qui se lie à un large éventail de ligands et les internalise, notamment des lipoprotéines modifiées et des macromolécules polyanioniques. SREC contribue au trafic endocytique, à l’adhérence cellulaire et à l’élimination de matériel extracellulaire, reliant l’endothélium vasculaire et la surveillance immunitaire aux voies d’endocytose impliquées dans l’homéostasie. Par ses rôles dans la reconnaissance et l’internalisation des ligands, SCARF1 est étudié dans des processus tels que l’inflammation, les réponses au stress oxydatif et la biologie vasculaire, où une activité altérée des récepteurs scavengers peut influencer les microenvironnements tissulaires. Une dérégulation des voies des récepteurs scavengers a été associée à des mécanismes de maladies cardiométaboliques et inflammatoires, ce qui fait de SCARF1 une cible utile pour analyser les interactions endothélium–immunité dans des systèmes modèles humains.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SREC (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SCARF1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SCARF1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SCARF1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SREC.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SCARF1 pour l'étude de la signalisation de SREC, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SCARF1 essentiels à la fonction de SREC
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SCARF1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SREC plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SREC plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SCARF1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SREC plasmide HDR (h) et le SREC (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SCARF1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SCARF1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.