Six1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-422956

Descripción general

Six1 (homólogo 1 del homeobox sine oculis) codifica un factor de transcripción homeobox que regula el patrón embrionario y la organogénesis en el ratón, con funciones destacadas en la miogénesis, la nefrogénesis y el desarrollo de las placodas sensoriales. SIX1 coordina programas de especificación de linaje y proliferación mediante redes de control transcripcional que interactúan con vías de señalización del desarrollo, incluidas las interacciones con coactivadores EYA y la modulación de conjuntos de genes de crecimiento y diferenciación. La expresión o actividad desregulada de SIX1 se asocia con trayectorias del desarrollo aberrantes y se ha estudiado en el contexto de anomalías congénitas y programas transcripcionales oncogénicos. En las células, los circuitos transcripcionales dependientes de Six1 influyen en la progresión del ciclo celular, la migración y las transiciones de estado epitelio–mesénquima relevantes para la biología del desarrollo y el modelado de enfermedades.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Six1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Six1 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Six1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Six1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Six1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Six1 para la investigación de la señalización de Six1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Six1 críticos para la función de Six1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Six1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Six1 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido Six1 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Six1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Six1 (m) y el plásmido HDR Six1 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Six1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Six1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.