NUDT21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402082

概要

NUDT21は、UGUAモチーフを認識して前駆体mRNAの3′末端プロセシングおよびポリ(A)付加を促進する切断因子Im（CFIm）複合体の中核サブユニットをコードする。選択的ポリアデニル化部位（alternative polyadenylation）の選択に影響することで、NUDT21は3′UTR長、mRNAの安定性、翻訳産物量の制御に寄与し、増殖・分化・ストレス応答に関連する遺伝子発現プログラムを形成する。NUDT21の活性変化は、選択的ポリアデニル化の広範な変動と関連し、microRNAによる制御やRNA結合タンパク質との相互作用を含む調節ネットワークを再編し得る。これらのRNAプロセシング経路の破綻は、がんに伴うトランスクリプトーム再編や神経発達に関わる表現型など、さまざまな疾患関連の状況で示唆されている。

NUDT21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるNUDT21遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、NUDT21内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、NUDT21のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NUDT21タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NUDT21シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、NUDT21欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NUDT21の機能に不可欠なNUDT21エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、NUDT21ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NUDT21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびNUDT21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、NUDT21遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NUDT21 HDRプラスミド（h）および NUDT21 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNUDT21ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNUDT21標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。