IRX4 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405618

Übersicht

IRX4 (Iroquois Homeobox 4) kodiert einen Homeodomänen-Transkriptionsfaktor, der während der Entwicklung räumlich und zeitlich abgestimmte Genexpressionsprogramme reguliert, mit wichtigen Funktionen im Herzen und in weiteren mesodermalen Zelllinien. Als nukleäres DNA-bindendes Protein trägt IRX4 zu Transkriptionsnetzwerken bei, die Zellschicksalsentscheidungen, Differenzierung und Gewebemusterbildung steuern, indem es nachgeschaltete Zielgene moduliert und mit umfassenderen, homeobox-regulierten Signalwegen interagiert. Eine fehlregulierte IRX4-Expression oder veränderte regulatorische Schaltkreise werden mit veränderter Entwicklungs-Signalgebung und kontextabhängigen Transkriptionszuständen in der Krebsbiologie in Verbindung gebracht, was IRX4 für Studien zur Linienspezifikation und krankheitsassoziierten Genregulation relevant macht.

Das IRX4 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des IRX4-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des IRX4-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von IRX4 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die IRX4-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von IRX4-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der IRX4-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf IRX4-Exone abzielen, die für die IRX4-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere IRX4-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom IRX4 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom IRX4 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des IRX4-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das IRX4 HDR-Plasmid (h) und IRX4 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von IRX4-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten IRX4-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.