IFRD1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-421053

Übersicht

Ifrd1 (interferonbezogener Entwicklungsregulator 1; auch bekannt als Tis7/PC4) kodiert einen transkriptionellen Koregulator, der Genexpressionsprogramme moduliert, welche die Zelldifferenzierung, Proliferation und Stressantworten steuern. IFRD1 interagiert mit chromatinassoziierten Komplexen und kann inflammatorische Signalwege, myogene und neuroentwicklungsbezogene Prozesse sowie transkriptionelle Outputs beeinflussen, die mit der Funktion von Immunzellen verknüpft sind. In Mausmodellen wurde eine veränderte Ifrd1-Aktivität mit Änderungen der Effektorfunktionen von Neutrophilen und Gewebereparatur-Phänotypen in Verbindung gebracht, was seine Relevanz für Studien zu Entzündung und degenerativen Prozessen unterstreicht. Da IFRD1 kontextabhängige transkriptionelle Netzwerke beeinflusst, wird es häufig im Zusammenhang mit Mechanismen der Linienfestlegung, Regeneration und der Wirtsantwort-Biologie untersucht.

Das IFRD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Ifrd1-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Ifrd1-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Ifrd1 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die IFRD1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Ifrd1-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der IFRD1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Ifrd1-Exone abzielen, die für die IFRD1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Ifrd1-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom IFRD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom IFRD1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Ifrd1-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das IFRD1 HDR-Plasmid (m) und IFRD1 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Ifrd1-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Ifrd1-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.