hnRNP R Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-404489

Descripción general

HNRNPR codifica la ribonucleoproteína nuclear heterogénea humana R (hnRNP R), una proteína de unión a ARN que se asocia con transcritos nacientes y complejos ribonucleoproteicos para regular el procesamiento del pre-ARNm, la estabilidad del ARNm y la localización subcelular del ARN. hnRNP R contribuye a la regulación génica posranscripcional mediante interacciones que influyen en el empalme alternativo y el transporte de ARN, vinculando el metabolismo nuclear del ARN con el control de la traducción en el citoplasma. La desregulación de proteínas de unión a ARN y de redes asociadas al empalme se ha implicado en mecanismos de enfermedades neurodegenerativas y neuromusculares, lo que convierte a HNRNPR en un nodo útil para estudiar la homeostasis del ARN. El estudio experimental de hnRNP R respalda análisis a nivel de vías sobre la remodelación del transcriptoma, la dinámica de gránulos de ARN sensibles al estrés y fenotipos relacionados con la proteostasis.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO hnRNP R (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen HNRNPR en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del HNRNPR junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de HNRNPR tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína hnRNP R.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en HNRNPR para la investigación de la señalización de hnRNP R, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de HNRNPR críticos para la función de hnRNP R
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de HNRNPR para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido hnRNP R CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido hnRNP R CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus HNRNPR. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR hnRNP R (h) y el plásmido HDR hnRNP R (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología HNRNPR para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana HNRNPR definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.