DDX21 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (bovine): sc-437356

Descripción general

DDX21 codifica una helicasa de ARN tipo DEAD-box nucleolar que coordina múltiples etapas de la biogénesis ribosomal, incluida la transcripción y el procesamiento del pre-rARN, y sostiene la función nucleolar dependiente de la ARN polimerasa I. A través de su actividad de remodelación de ARN, DDX21 ayuda a integrar la maduración del rARN con programas más amplios de metabolismo del ARN que influyen en la progresión del ciclo celular, la proteostasis y las respuestas al estrés celular. La alteración de la función de DDX21 se asocia con cambios en la integridad nucleolar y en la capacidad de traducción, procesos que se estudian con frecuencia en contextos como la señalización proliferativa, la estabilidad genómica y los fenotipos de adaptación al estrés. En sistemas bovinos, DDX21 es relevante para investigaciones mecanísticas sobre crecimiento y desarrollo, interacciones hospedador–patógeno que afectan la producción ribosomal y la regulación de la expresión génica vinculada al nucléolo.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO DDX21 (bovine) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen en líneas celulares bovine. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína DDX21.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en para la investigación de la señalización de DDX21, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de críticos para la función de DDX21
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido DDX21 CRISPR/Cas9 KO (bovine) y el plásmido DDX21 CRISPR/Cas9 KO (bovine2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus . Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR DDX21 (bovine) y el plásmido HDR DDX21 (bovine2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.