ARP-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-419169

Übersicht

Nr2f2 kodiert den nukleären Rezeptor ARP-1 (auch als COUP-TFII bekannt), einen ligandenregulierten Transkriptionsfaktor, der an Hormon-Response-Elemente bindet und Genprogramme koordiniert, die die embryonale Entwicklung, den vaskulären Umbau, die Lymphangiogenese und die metabolische Homöostase steuern. ARP-1 integriert Signale von Retinsäure und weiteren nukleären Rezeptor-Netzwerken, um Chromatinzustand und Transkriptionsoutput in mesenchymalen, endothelialen und stromalen Kontexten zu modulieren. In Mausmodellen beeinflusst eine veränderte Nr2f2-Aktivität die Festlegung von Zellschicksalen, angiogene Signalwege und die Gewebemusterung und verknüpft diesen Signalweg mit Entwicklungsanomalien und einer dysregulierten vaskulären Biologie. Nr2f2-regulierte Transkriptionsschaltkreise werden außerdem genutzt, um Mechanismen zu untersuchen, die Tumormikroumgebungen, Zellmigration und epithelo-mesenchymale Interaktionen in krebsrelevanten Systemen prägen, ohne dabei klinische Ergebnisse zu implizieren.

Das ARP-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Nr2f2-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Nr2f2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Nr2f2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die ARP-1-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Nr2f2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der ARP-1-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Nr2f2-Exone abzielen, die für die ARP-1-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Nr2f2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom ARP-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom ARP-1 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Nr2f2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das ARP-1 HDR-Plasmid (m) und ARP-1 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Nr2f2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Nr2f2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.