TRAF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423492

概要

Traf1は、腫瘍壊死因子（TNF）受容体関連因子1（TRAF1）をコードしており、TNF受容体スーパーファミリーのメンバーを下流のシグナル伝達複合体へとつなぐアダプタータンパク質です。免疫・炎症の文脈では、TRAF1はカノニカルおよびノンカノニカルなNF-κBシグナル伝達を調節し、MAPK経路の出力に影響を与えるほか、TRAF2やcIAPsなどのタンパク質との相互作用を通じて、アポトーシスと生存の意思決定にも関与します。これらの作用は、サイトカイン応答、リンパ球活性化、自然免疫シグナル伝達の制御に寄与し、Traf1は免疫細胞におけるシグナル統合を解析するための有用なノードとなっています。TRAF1関連経路の破綻は、炎症性疾患の機序や、免疫腫瘍学に関連する微小環境シグナル伝達への関与が示唆されており、経路に焦点を当てた研究モデルにおける幅広い有用性を裏づけています。

TRAF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるTraf1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Traf1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Traf1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TRAF1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TRAF1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Traf1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TRAF1の機能に不可欠なTraf1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Traf1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TRAF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびTRAF1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Traf1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TRAF1 HDRプラスミド（m）および TRAF1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTraf1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTraf1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。