TDRD1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-410043

Descripción general

TDRD1 (Tudor domain containing 1) es una proteína de unión a ARN enriquecida en la línea germinal que reconoce residuos de arginina dimetilados de forma simétrica en proteínas de la familia PIWI y favorece el ensamblaje de la vía de piRNA. A través de estas interacciones, TDRD1 contribuye al silenciamiento de transposones, al mantenimiento de la integridad del genoma y a la progresión adecuada de la espermatogénesis al coordinar la biogénesis de piRNA y la organización de los gránulos germinales. La alteración de la vigilancia de piRNA dependiente de TDRD1 se asocia con defectos en el desarrollo de las células germinales masculinas y con fenotipos de fertilidad reducida, lo que refleja su papel central en la protección del genoma de la línea germinal. La expresión alterada y los programas germinales desregulados que involucran a TDRD1 también se han investigado en el contexto de la biología de los antígenos cáncer-testículo y de la desregulación epigenética en tumores.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO TDRD1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen TDRD1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del TDRD1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de TDRD1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína TDRD1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en TDRD1 para la investigación de la señalización de TDRD1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de TDRD1 críticos para la función de TDRD1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de TDRD1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido TDRD1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido TDRD1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus TDRD1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR TDRD1 (h) y el plásmido HDR TDRD1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología TDRD1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana TDRD1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.