Plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-4 (h): sc-401217

Présentation

SOX4 code le facteur de transcription Sox-4, une protéine de liaison à l’ADN de type « high-mobility group » (HMG) qui régule la spécification des lignages, la différenciation et les choix de destinée cellulaire au cours du développement et du maintien de l’homéostasie tissulaire. Sox-4 participe à des programmes transcriptionnels liés aux voies de signalisation Wnt/β-caténine et TGF-β/SMAD, et peut influencer la transition épithélio-mésenchymateuse, le contrôle du cycle cellulaire et l’apoptose selon le contexte cellulaire. Une expression altérée de SOX4 a été associée à une dérégulation du maintien des progéniteurs et à des réseaux transcriptionnels aberrants observés dans de multiples contextes de recherche en cancérologie et en immunologie. En tant que régulateur nodal de l’expression génique, Sox-4 est fréquemment étudié pour ses effets sur les circuits transcriptionnels associés à la chromatine et les interactions entre voies de signalisation.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-4 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SOX4 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SOX4, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SOX4 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine Sox-4.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SOX4 pour l'étude de la signalisation de Sox-4, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SOX4 essentiels à la fonction de Sox-4
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SOX4 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le Sox-4 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le Sox-4 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SOX4. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le Sox-4 plasmide HDR (h) et le Sox-4 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SOX4 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SOX4 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.