IRF-1 Particelle di Attivazione Lentivirale (h): sc-400551-LAC

Il fattore regolatore dell’interferone 1 (IRF1) codifica IRF-1, un fattore di trascrizione specifico per sequenza indotto dagli interferoni di tipo I e II che coordina i programmi genici dell’immunità innata e adattativa. IRF-1 regola la presentazione dell’antigene, la restrizione antivirale, la segnalazione delle citochine infiammatorie e i checkpoint del ciclo cellulare e dell’apoptosi tramite vie che includono la segnalazione JAK–STAT e reti trascrizionali basate sugli elementi di risposta stimolati dall’interferone (ISRE). Modellando l’attivazione dei macrofagi, la differenziazione delle cellule T e l’espressione dell’MHC, IRF-1 influenza la sorveglianza immunitaria e le risposte allo stress, spesso alterate in corso di infezioni, autoimmunità ed elusione immunitaria associata al cancro. Un’attività di IRF1 deregolata è stata inoltre collegata ad alterazioni della risposta al danno al DNA e a fenotipi oncosoppressivi dipendenti dal contesto, rendendolo un nodo utile per la dissezione meccanicistica delle vie di segnalazione.

Le particelle di attivazione lentivirale IRF-1 (h) rispondono a questa esigenza incapsulando il sistema completo di attivazione trascrizionale del mediatore di attivazione sinergica (SAM) in particelle lentivirali ad alto titolo pronte per la trasduzione, consentendo un'efficiente sovraregolazione di IRF1 in una gamma più ampia di tipi di cellule umane.

Le particelle di attivazione lentivirale IRF-1 (h) veicolano tutti i componenti funzionali del sistema del mediatore di attivazione sinergica (SAM) tramite trasduzione lentivirale. Il sistema comprende tre preparati di particelle co-trasdotti nelle cellule bersaglio: uno che codifica per dCas9 cataliticamente inattivo (mutazioni D10A e N863A) fuso al dominio di transattivazione VP64 con un gene di resistenza alla blasticidina; una che codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1 con un gene di resistenza all'igromicina; e una che codifica un sgRNA di 20 nt specifico per il bersaglio fuso a due aptameri di RNA MS2 con un gene di resistenza alla puromicina. A seguito della trasduzione lentivirale e dell'integrazione genomica dei cassetti di espressione, i componenti del SAM vengono espressi in modo stabile e si assemblano nel locus bersaglio all'interno della regione promotrice prossimale a monte del sito di inizio della trascrizione IRF1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo cooperativo per reclutare il machinery trascrizionale endogeno e guidare una sovraregolazione sostenuta dell'espressione endogena di IRF-1. L'uso di dCas9 inattivo nei confronti delle nucleasi evita l'introduzione di rotture del DNA a doppio filamento e preserva il locus genomico nativo IRF1 e l'architettura regolatoria.

Il formato lentivirale offre diversi vantaggi pratici: l'integrazione genomica stabile supporta l'attivazione ereditaria attraverso le divisioni cellulari; le preparazioni di particelle ad alto titolo eliminano la necessità di una produzione virale interna; e la compatibilità con tipi di cellule primarie, non in divisione e resistenti alla trasfezione amplia l'accessibilità sperimentale. Il successo della trasduzione può essere confermato e potenziato attraverso una selezione antibiotica tripla utilizzando puromicina, igromicina e blasticidina.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.