HMG-I/HMG-Y Double Nickaseプラスミド (m): sc-420879-NIC
- 対象生物種: mouse
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- HMG-I/HMG-Y Double Nickaseプラスミド (m)はペアのプラスミドを含みます。それぞれのプラスミドはD10A変異したCas9 nuclease、及びCRISPR/Cas9 KOの対応よりも高い特異性で遺伝子発現をノックアウトするように設計された標的特異的な20 ntガイドRNA (gRNA)をコードします。
- ペアリングしたガイドRNAは、約20 bpでずらすことにより、ゲノムDNAの特定Cas9媒介のdouble nickingを可能にし、DSBを模造します。
- ペアの1つのプラスミドは選択用のピューロマイシン耐性遺伝子を含みます；ペアのほかの1つのプラスミドは、視覚的にトランスフェクションを確認するGFPマーカーを含みます。
- HMG-I/HMG-Yダブルニカースプラスミド（m）およびHMG-I/HMG-Yダブルニカースプラスミド（m2）は、Hmga1を標的とする異なるペアのgRNA設計をコードしています。いずれか一方、あるいは両方のデザインが利用可能である場合があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: HMG-I/HMG-Y 抗体 (D-12): sc-393213
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
HMG-I/HMG-Y Double Nickaseプラスミド (m) | sc-420879-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
HMG-I/HMG-Y Double Nickaseプラスミド (m2) | sc-420879-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
Hmga1は、クロマチン結合性の構造タンパク質HMG-I/HMG-Yをコードしている。HMG-I/HMG-YはAT-hook型のDNA結合因子として、局所的なクロマチン構造を再編成し、ATリッチな調節領域におけるエンハンセオソームの組み立てを促進する。転写因子のアクセス性や高次クロマチン構造を調節することで、HMG-I/HMG-Yは細胞周期進行、分化、ストレス応答性転写を制御する遺伝子発現プログラムに影響し、MAPKをはじめとする有糸分裂促進シグナル下流の経路も含まれる。マウス系では、Hmga1の機能は発生制御や、系譜特異的転写ネットワークのエピジェネティックな制御という文脈でしばしば検討される。HMGA1/HMG-I/HMG-Yの機能異常は、がん化に伴う異常な転写状態や細胞可塑性の変化と関連づけられており、疾患に関連する遺伝子制御を機構的に解析する研究において重要なハブ（ノード）として用いられる根拠となっている。
HMG-I/HMG-Y ダブルニカースプラスミド（m）は、mouse 細胞株における Hmga1 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、Hmga1内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、Hmga1の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。
編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、Hmga1が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。