Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
HIF PHD2 Double Nickaseプラスミド (h): sc-403334-NIC
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- HIF PHD2 Double Nickaseプラスミド (h)はペアのプラスミドを含みます。それぞれのプラスミドはD10A変異したCas9 nuclease、及びCRISPR/Cas9 KOの対応よりも高い特異性で遺伝子発現をノックアウトするように設計された標的特異的な20 ntガイドRNA (gRNA)をコードします。
- ペアリングしたガイドRNAは、約20 bpでずらすことにより、ゲノムDNAの特定Cas9媒介のdouble nickingを可能にし、DSBを模造します。
- ペアの1つのプラスミドは選択用のピューロマイシン耐性遺伝子を含みます；ペアのほかの1つのプラスミドは、視覚的にトランスフェクションを確認するGFPマーカーを含みます。
- HIF PHD2ダブルニカースプラスミド（h）およびHIF PHD2ダブルニカースプラスミド（h2）は、EGLN1を標的とする異なるペアのgRNA設計をコードしています。いずれか一方、あるいは両方のデザインが利用可能である場合があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: HIF PHD2 抗体 (H-8): sc-271835
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
HIF PHD2 Double Nickaseプラスミド (h) | sc-403334-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
HIF PHD2 Double Nickaseプラスミド (h2) | sc-403334-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
EGLN1はHIFプロリルヒドロキシラーゼ2（PHD2）をコードしており、鉄および2-オキソグルタル酸依存性反応によりHIF-αサブユニットを水酸化する、酸素感知型のジオキシゲナーゼです。常酸素下では、この修飾によってVHL介在性のユビキチン化とプロテアソーム分解が促進され、血管新生、解糖系代謝、赤血球産生、細胞生存を制御する転写プログラムが抑制されます。PHD2は、酸素利用可能性、ミトコンドリア代謝、活性酸素種からの入力を統合し、低酸素誘導性シグナル伝達を微調整します。EGLN1/HIF経路の活性異常は、酸素恒常性の障害に関連するとともに、がん生物学、虚血モデル、炎症性微小環境における低酸素駆動性の表現型に寄与することが示されています。
HIF PHD2 ダブルニカースプラスミド（h）は、human 細胞株における EGLN1 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、EGLN1内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、EGLN1の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。
編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、EGLN1が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。