FBP1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-424568
- Especies Diana: mouse
- 20 µg de plásmido de ADN purificado listo para la trasfección; suficiente para 20 transfecciones máximo
- FBP1 El plásmido CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (m) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales codifica la nucleasa Cas9 y un ARN guía (gRNA) de 20 nt específico para el objetivo, diseñado para lograr la máxima eficiencia de knockout utilizando secuencias derivadas de la biblioteca GeCKO v2
- Las secuencias de gRNA dirigen a Cas9 para que induzca roturas de doble cadena (DSB) específicas en el locus genómico FBP1, lo que da lugar a la inactivación del gen mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ)
- Se recomienda el plásmido HDR FBP1 (m) (sc-424568-HDR) para la cotransfección con el plásmido CRISPR/Cas9 KO FBP1 (m) a fin de permitir la selección de células editadas con éxito mediante la integración mediada por HDR de un casete de resistencia a la puromicina y un gen reportero RFP
- El plásmido HDR FBP1 (m) es un conjunto de plásmidos, cada uno de los cuales contiene una plantilla de reparación dirigida por homología (HDR) correspondiente a los sitios diana del ARN guía (gRNA) en el plásmido CRISPR/Cas9 KO FBP1 (m)
- Cada plásmido HDR contiene dos brazos de homología de ~800 pb que flanquean los casetes de resistencia a la puromicina y RFP, diseñados para unirse a secuencias de ADN genómico que rodean el sitio de rotura de doble cadena inducida por Cas9 y facilitar la integración precisa mediada por HDR
- Los genes de resistencia a la puromicina y RFP están flanqueados por sitios LoxP, lo que permite la eliminación de los marcadores de selección mediante la recombinasa Cre (Vector Cre: sc-418923) tras el establecimiento de líneas celulares knockout estables
- Tras la transfección, la eficacia del knockout puede comprobarse mediante WB, IF ó IHC utilzando el anticuerpo: FBP1 Anticuerpo (G-8): sc-271241
Información sobre pedidos
| Nombre del producto | Número de catálogo | UNIDAD | Precio | CANTIDAD | Favoritos | |
FBP1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m) | sc-424568 | 20 µg | $397.00 | |||
FBP1 Plásmido HDR (m) | sc-424568-HDR | 20 µg | $445.00 |
Descripción general
Fubp1 codifica la proteína 1 de unión a elementos muy río arriba (FBP1), un regulador de unión a ssDNA/ARN que reconoce elementos FUSE para modular programas transcripcionales, incluido el control dependiente del contexto de Myc y otros genes asociados al crecimiento. FBP1 participa en el metabolismo del ARN, acoplando la transcripción con la estabilidad del ARNm y la traducción, e influye en la progresión del ciclo celular, la diferenciación y la expresión génica en respuesta al estrés. En sistemas murinos, la alteración de la actividad de Fubp1 se ha vinculado con una proliferación desregulada y programas de linaje anómalos, lo que la hace relevante para estudios de redes transcripcionales oncogénicas y biología del neurodesarrollo.
El plásmido CRISPR/Cas9 KO FBP1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen Fubp1 en líneas celulares mouse. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus Fubp1, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.
Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.
Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP
Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR FBP1 (m) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido Fubp1.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido FBP1 CRISPR/Cas9 KO (m):
- El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto Fubp1.
La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.
Sistema de eliminación del casete Cre-lox
La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus Fubp1 y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:
- Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales
Características principales
- gRNA dirigido a los exones Fubp1 críticos para la función FBP1
Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
Se suministra listo para su uso mediante transfección
Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.