Exportin 6 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-404915

Panoramica

XPO6 codifica per exportina 6, un recettore di esportazione nucleare dipendente da RanGTP che media il trasporto selettivo dei complessi profilina–actina dal nucleo al citoplasma. Controllando la disponibilità di actina nucleare, l’exportina 6 influenza il rimodellamento della cromatina dipendente dall’actina, la regolazione della trascrizione e l’architettura nucleare legata al ciclo cellulare. Questa via di traffico nucleocitoplasmatico si interfaccia con reti più ampie di trasporto Ran/importine–exportine che coordinano programmi di espressione genica e risposte allo stress. Dinamiche dell’actina alterate e la regolazione del trasporto nucleare che coinvolge XPO6 sono state studiate in contesti rilevanti per il comportamento delle cellule tumorali e per altri disturbi caratterizzati da disregolazione del citoscheletro e della trascrizione.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Exportin 6 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene XPO6 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del XPO6 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto XPO6 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Exportin 6.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di XPO6 per lo studio della segnalazione di Exportin 6, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni XPO6 critici per la funzione di Exportin 6
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di XPO6 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Exportin 6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Exportin 6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus XPO6. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Exportin 6 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Exportin 6 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia XPO6 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio XPO6 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.