PPWD1 억제제는 프롤린 함유 단백질에서 펩타이드 결합의 이성질화에 관여하고 WD 반복 도메인을 통해 단백질과 단백질의 상호작용을 매개하는 단백질인 PPWD1의 기능적 활동을 방해하는 다양한 방식으로 작용합니다. 이러한 억제제 중 일부는 PPWD1의 펩티딜-프롤릴 이성질화 효소 도메인을 직접 표적으로 하여 활성 부위에 결합하고 효소 활성을 방해합니다. 이러한 결합 작용은 많은 단백질의 적절한 폴딩에 필수적인 단계인 펩타이드 결합의 시스 및 트랜스 이성질체의 전환을 PPWD1이 촉매하는 것을 방해할 수 있습니다. 다른 억제제는 관련 사이클로필린 도메인에 결합하여 경쟁적 억제 기능을 발휘하여 PPWD1의 이성질체분해효소 활성을 감소시킬 수 있습니다. 이러한 경쟁적 저해는 이러한 화합물이 이소머라제 도메인의 천연 기질과 공유하는 구조적 유사성 때문에 특히 효과적일 수 있습니다.
또한, 몇몇 억제제는 PPWD1의 기능에 간접적으로 영향을 미치는 세포 과정을 방해하는 방식으로 작용합니다. 예를 들어, mTOR 신호를 억제하는 화합물은 단백질 번역 및 폴딩 경로에 광범위한 장애를 일으켜 성숙을 위해 PPWD1이 필요한 단백질의 스펙트럼에 영향을 미칠 수 있습니다. 프로테아좀을 억제하면 세포 내에 잘못 접힌 단백질이 축적되어 PPWD1을 포함한 샤프론 시스템에 과부하가 걸리고 이성질체화 활동이 기능적으로 손상될 수 있습니다. 마찬가지로, Hsp90의 억제제는 다양한 클라이언트 단백질의 성숙을 방해하여 PPWD1과 상호 작용하거나 기질이 되는 단백질에 영향을 미칠 수 있습니다. 단백질 합성 과정을 억제함으로써 일반적으로 PPWD1의 기질이 되는 초기 폴리펩타이드의 가용성을 감소시켜 단백질 폴딩 및 성숙에서 PPWD1의 역할을 감소시키는 경우도 있습니다.
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