Herc1의 화학적 억제제는 주로 유비퀴틴-프로테아좀 경로를 차단하는 방식으로 작용하는데, 이는 Herc1이 원치 않거나 손상된 단백질에 태그를 붙여 분해하는 데 활용하는 세포 메커니즘입니다. 예를 들어 MG132는 프로테아좀의 강력한 가역적 억제제 역할을 하여 Herc1이 유비퀴틴으로 표시한 단백질의 분해를 방지합니다. 이로 인해 세포 내에 이러한 단백질이 축적되어 일반적으로 관리되는 단백질 수준의 일반적인 회전율과 조절을 중단함으로써 Herc1을 기능적으로 억제합니다. 마찬가지로 에폭소미닌은 선택적이고 비가역적인 프로테아좀 억제제로 작용하여 동일한 분해 경로를 표적으로 삼고 유비퀴틴화된 기질의 분해를 방해함으로써 Herc1의 활성을 유사하게 억제하는 역할을 합니다.
락타시스틴과 보르테조밉은 모두 프로테아좀 억제 메커니즘을 공유하며, 락타시스틴은 20S 프로테아좀에 공유 결합하고 보르테조밉은 붕산 모이티를 활용하여 26S 프로테아좀을 억제합니다. 이러한 상호 작용으로 인해 일반적으로 Herc1 태그가 부착된 단백질을 분해하는 단백질 분해 기능이 차단됩니다. 비가역적 프로테아좀 억제제인 카르필조밉, 오프로조밉, 마리조밉도 마찬가지로 유비퀴틴화된 단백질이 분해되지 않도록 하여 세포의 단백질 항상성을 유지하는 Herc1의 역할을 방해함으로써 Herc1의 기능을 저해하는 것으로 이어집니다. 익사조밉, 델란조밉, 넬피나비르는 프로테아좀과 결합하여 프로테아좀 활성을 억제함으로써 Herc1이 의존하는 프로테아좀 분해를 방지하여 기능에 직접적인 영향을 미칩니다. 또 다른 프로테아좀 억제제인 위타페린 A는 유사한 기능을 하여 Herc1의 표적 단백질의 분해 과정을 방지합니다. 마지막으로, 디설피람은 프로테아좀 분해 경로를 억제할 수 있는데, 이는 Herc1이 분해 표시를 한 단백질의 축적을 유발하여 세포 내에서 단백질의 조절 활동을 중단시킴으로써 Herc1을 간접적으로 억제합니다.
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