ZCCHC11 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-411714

Descripción general

ZCCHC11 (también conocido como TUT4) codifica una uridiltransferasa de ARN tipo dedo de zinc CCHC que cataliza la uridilación terminal 3′ de diversos sustratos de ARN, incluidos microARN precursores y maduros y determinados ARNm. Al modificar los extremos 3′ del ARN, ZCCHC11 influye en la estabilidad del ARN y en las vías de degradación, en la biogénesis de los miARN y en la regulación génica posranscripcional, con una interacción funcional que incluye el control dependiente de LIN28 de los miARN de la familia let-7. Esta actividad vincula a ZCCHC11 con programas reguladores que gobiernan la diferenciación, la proliferación y la remodelación del transcriptoma en respuesta al estrés. La expresión o actividad desregulada de ZCCHC11 se ha estudiado en contextos de redes de miARN aberrantes y señalización oncogénica, lo que lo hace relevante para estudios mecanísticos en biología del cáncer y metabolismo del ARN.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO ZCCHC11 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen ZCCHC11 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del ZCCHC11 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de ZCCHC11 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína ZCCHC11.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en ZCCHC11 para la investigación de la señalización de ZCCHC11, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de ZCCHC11 críticos para la función de ZCCHC11
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de ZCCHC11 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido ZCCHC11 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido ZCCHC11 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus ZCCHC11. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR ZCCHC11 (h) y el plásmido HDR ZCCHC11 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología ZCCHC11 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana ZCCHC11 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.