SRp55 CRISPR Activationプラスミド (h): sc-401621-ACT

SRSF6は、ヒトのセリン/アルギニンに富むスプライシング因子SRp55をコードしており、スプライス部位の選択を転写共役的なRNAプロセシングおよびmRNA輸送と結び付けるRNA結合タンパク質です。SRp55はスプライソソームの組み立てに関与し、増殖・分化・ストレス応答を制御するアイソフォーム発現プログラムを形作る選択的スプライシングの決定を調節します。エクソンの取り込みやエクソン–イントロン構造の調整を通じて、SRSF6は細胞周期の進行、アポトーシス、ならびに転写産物アイソフォームのバランスに影響を受けやすいシグナル伝達ネットワークなど、下流の経路に影響を及ぼします。SRSF6の発現または活性の破綻は、複数の疾患状況で観察される異常なスプライシングパターンと関連付けられていることが文献で示されており、ヒト細胞におけるスプライシング駆動性表現型を研究するための機構的ハブとしての有用性を支持しています。

SRp55 CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SRSF6の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。

SRp55 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SRSF6 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。

標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSRSF6転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性SRp55の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSRSF6遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるSRp55依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSRSF6発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるSRp55経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。