Sox-13 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-409568

Übersicht

SOX13 kodiert Sox‑13, einen Transkriptionsfaktor der SOX‑Familie mit High‑Mobility‑Group(HMG)-Box, der an DNA bindet, um linienspezifische Genexpressionsprogramme zu modulieren. Sox‑13 ist an Entwicklungs- und Differenzierungsprozessen beteiligt, einschließlich der Regulation transkriptioneller Netzwerke, die Zellschicksalsentscheidungen und die immunbezogene Genexpression prägen. In menschlichen Zellen wird die SOX13‑Aktivität mit Signalwegen in Verbindung gebracht, die die transkriptionelle Kontrolle und die chromatinabhängige Regulation steuern; in bestimmten Kontexten wurden zudem Zusammenhänge mit Immunfehlregulation und krebsassoziierten transkriptionellen Zuständen beschrieben. Die Aufklärung der SOX13‑Funktion hilft zu verstehen, wie SOX‑Faktoren genregulatorische Schaltkreise koordinieren, die Proliferation, Differenzierung und stressresponsive Transkription beeinflussen.

Das Sox-13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des SOX13-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des SOX13-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von SOX13 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Sox-13-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von SOX13-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Sox-13-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf SOX13-Exone abzielen, die für die Sox-13-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere SOX13-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Sox-13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Sox-13 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des SOX13-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Sox-13 HDR-Plasmid (h) und Sox-13 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von SOX13-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten SOX13-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.