Set1B Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-406129

Descripción general

SETD1B codifica la metiltransferasa de lisina Set1B, un componente catalítico de complejos modificadores de la cromatina tipo COMPASS que depositan marcas de metilación de H3K4 asociadas con cromatina transcripcionalmente activa. Mediante la regulación de los estados de promotores y potenciadores (enhancers), Set1B contribuye a programas de expresión génica dependientes de la ARN polimerasa II que influyen en la identidad celular, la proliferación y la diferenciación. La actividad de SETD1B se integra con vías epigenéticas más amplias que controlan la accesibilidad de la cromatina y las respuestas al daño del ADN, al moldear los paisajes de modificaciones de histonas. La variación genética y la desregulación de SETD1B se han vinculado a fenotipos del neurodesarrollo y a un control transcripcional alterado, lo que lo convierte en un objetivo relevante para estudios mecanísticos de la regulación génica en células humanas.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO Set1B (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen SETD1B en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del SETD1B junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de SETD1B tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína Set1B.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en SETD1B para la investigación de la señalización de Set1B, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de SETD1B críticos para la función de Set1B
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de SETD1B para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido Set1B CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido Set1B CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus SETD1B. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR Set1B (h) y el plásmido HDR Set1B (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología SETD1B para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana SETD1B definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.