RUNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-419487

概要

Runx3は転写因子RUNX3をコードしており、RUNX3はRuntドメインをもつDNA結合タンパク質としてCBFBと協調し、複数の組織における系譜指定および分化プログラムを制御します。マウスの免疫系および上皮系では、RUNX3はTGF-β/SMADなどのシグナル伝達経路や発生に関わる転写ネットワークからのシグナルを統合し、細胞運命の決定、成熟、ならびに状況依存的な増殖制御を調節します。Runx3活性の変化は、モデル生物において炎症、腫瘍形成、神経発達に関連する表現型と結び付く転写プログラムの破綻と関連していることが報告されています。プロモーターおよびエンハンサー制御の結節点として、RUNX3はクロマチン依存的な遺伝子発現や下流経路の再編成に及ぼす影響の観点から、しばしば研究対象となっています。

RUNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるRunx3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Runx3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Runx3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、RUNX3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、RUNX3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Runx3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• RUNX3の機能に不可欠なRunx3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Runx3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• RUNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびRUNX3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Runx3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  RUNX3 HDRプラスミド（m）および RUNX3 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはRunx3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のRunx3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。