NYNRIN Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-410066

Panoramica

NYNRIN codifica una grande proteina multidominio che, secondo quanto riportato, contiene regioni di tipo NYN e simili alle integrasi retrovirali, suggerendo possibili legami con interazioni con acidi nucleici o complessi proteici, sebbene la sua precisa funzione molecolare nelle cellule umane non sia ancora stata caratterizzata in modo completo. Studi trascrittomici hanno associato l’espressione di NYNRIN a programmi di sviluppo e differenziamento e alla regolazione dell’omeostasi cellulare in tessuti specifici. Alterazioni dell’espressione di NYNRIN sono state osservate in molteplici contesti patologici, sostenendone l’utilità come fattore candidato per indagare reti di espressione genica deregolate. Essendo un gene relativamente poco studiato, NYNRIN viene spesso analizzato per definire la connettività tra vie di segnalazione, le transizioni di stato cellulare e i fenotipi che emergono da perturbazioni di regolatori scarsamente annotati.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO NYNRIN (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene NYNRIN in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del NYNRIN insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto NYNRIN a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina NYNRIN.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di NYNRIN per lo studio della segnalazione di NYNRIN, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni NYNRIN critici per la funzione di NYNRIN
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di NYNRIN per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal NYNRIN CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal NYNRIN CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus NYNRIN. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal NYNRIN Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR NYNRIN (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia NYNRIN per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio NYNRIN definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.