Plasmide CRISPR/Cas9 KO NYNRIN (h): sc-410066

Présentation

NYNRIN code une grande protéine multidomaine qui contiendrait des régions de type NYN et intégrase rétrovirale, ce qui suggère des liens avec des interactions impliquant des acides nucléiques ou des complexes protéiques, bien que sa fonction moléculaire précise dans les cellules humaines reste imparfaitement caractérisée. Des études transcriptomiques ont associé l’expression de NYNRIN à des programmes de développement et de différenciation, ainsi qu’à la régulation de l’homéostasie cellulaire dans certains tissus. Une expression altérée de NYNRIN a été observée dans de multiples contextes pathologiques, ce qui étaye son intérêt en tant que facteur candidat pour l’étude de réseaux d’expression génique dérégulés. En tant que gène encore relativement peu étudié, NYNRIN est souvent exploré afin de définir la connectivité des voies, les transitions d’état cellulaire et les phénotypes résultant de la perturbation de régulateurs encore mal annotés.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO NYNRIN (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène NYNRIN dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du NYNRIN, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert NYNRIN à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine NYNRIN.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en NYNRIN pour l'étude de la signalisation de NYNRIN, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de NYNRIN essentiels à la fonction de NYNRIN
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de NYNRIN pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le NYNRIN plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le NYNRIN plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus NYNRIN. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le NYNRIN plasmide HDR (h) et le NYNRIN (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie NYNRIN pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles NYNRIN définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.