NDRG3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-424349

概要

Ndrg3は、細胞質タンパク質であるNDRG3をコードしており、NDRGファミリーの一員として、細胞増殖・分化・ストレス適応の制御に関与するとされています。マウスの研究系では、NDRG3は代謝シグナル伝達や低酸素関連経路と関連づけられており、下流の転写プログラムに影響し得る、乳酸依存的な安定化機構なども含まれます。NDRG3活性の変化は、増殖制御や細胞生存の文脈で検討されてきたことから、代謝シグナルが組織恒常性をどのように形成するかを調べるうえで重要です。これらの機能により、NDRG3は栄養感知、低酸素応答、細胞運命決定の間の経路クロストークを解明するための有用な結節点（ノード）となります。

NDRG3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるNdrg3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Ndrg3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Ndrg3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NDRG3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NDRG3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Ndrg3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NDRG3の機能に不可欠なNdrg3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Ndrg3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NDRG3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびNDRG3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Ndrg3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NDRG3 HDRプラスミド（m）および NDRG3 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNdrg3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNdrg3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。