IRX5 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-404838

Panoramica

IRX5 codifica la proteina homeobox Iroquois 5, un fattore di trascrizione specifico di sequenza che regola la strutturazione dello sviluppo e le decisioni sul destino cellulare attraverso il controllo di programmi di espressione genica. Nelle cellule umane, l’attività di IRX5 contribuisce alla specificazione delle linee cellulari, alla morfogenesi dei tessuti e al mantenimento degli stati differenziati modulando reti trascrizionali che intersecano le vie di segnalazione dello sviluppo. Un’espressione deregolata di IRX5 è stata associata ad alterazioni dei fenotipi proliferativi e di differenziamento, a supporto della sua rilevanza negli studi sulla biologia tumorale e sui disturbi dello sviluppo. In quanto regolatore nucleare, IRX5 viene comunemente studiato per il suo impatto sul controllo trascrizionale associato alla cromatina e sull’organizzazione a valle delle vie di segnalazione.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO IRX5 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene IRX5 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del IRX5 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto IRX5 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina IRX5.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di IRX5 per lo studio della segnalazione di IRX5, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni IRX5 critici per la funzione di IRX5
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di IRX5 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal IRX5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal IRX5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus IRX5. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal IRX5 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR IRX5 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia IRX5 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio IRX5 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.