FOXF2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-420374

Übersicht

Forkhead-Box F2 (Foxf2) kodiert den Transkriptionsfaktor FOXF2, einen im Mesenchym stark angereicherten Regulator entwicklungsbezogener Genprogramme, die Gewebemusterbildung, die Organisation der extrazellulären Matrix und die epithelial-mesenchymale Signalübertragung prägen. In der Maus trägt die Foxf2-Aktivität zur Organogenese und zur stromalen Differenzierung bei, indem sie Transkriptionsnetzwerke steuert, die nachgeschaltet auf Morphogensignale reagieren, darunter Signalwege im Zusammenhang mit TGF-β/BMP-Signalisierung, Wnt-Modulation sowie Zytoskelett-/ECM-Remodeling. Eine fehlregulierte FOXF2-abhängige Transkription wurde in der Literatur mit verändertem Fibroblastenverhalten, aberranter Gewebearchitektur sowie Veränderungen stromaler Kompartimente, die mit Barrierefunktionen und Gefäßen assoziiert sind, in Verbindung gebracht, was seine Relevanz für krankheitsbezogene Remodeling-Phänotypen unterstreicht. Als Knotenpunkt der entwicklungs- und stromabezogenen Genregulation wird Foxf2 häufig in Kontexten wie fibroseähnlichen Reaktionen, Tumor–Stroma-Interaktionen und Entwicklungsanomalien in Mausmodellen untersucht.

Das FOXF2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Foxf2-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Foxf2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Foxf2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die FOXF2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Foxf2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der FOXF2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Foxf2-Exone abzielen, die für die FOXF2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Foxf2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom FOXF2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom FOXF2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Foxf2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das FOXF2 HDR-Plasmid (m) und FOXF2 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Foxf2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Foxf2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.