Plasmide CRISPR/Cas9 KO CXXC5 (h): sc-403248

Présentation

CXXC5 (protéine à doigt de zinc de type CXXC 5) est un régulateur nucléaire et cytoplasmique qui se lie à l’ADN riche en CpG via son domaine CXXC et s’inscrit dans le contrôle épigénétique de la transcription. Il agit comme un modulateur dépendant du contexte de la signalisation Wnt/β-caténine et participe à des voies qui gouvernent les décisions de destin cellulaire, la prolifération et la différenciation, avec des rôles rapportés dans les programmes hématopoïétiques et neuronaux. CXXC5 relie également la signalisation des facteurs de croissance et du stress aux réponses transcriptionnelles, influençant des processus associés à la chromatine et la dynamique de l’expression génique. Une expression dérégulée de CXXC5 a été associée à une signalisation Wnt aberrante et à des états de différenciation altérés observés dans plusieurs contextes pertinents pour la maladie, ce qui soutient l’étude de CXXC5 dans les mécanismes du développement et de la signalisation oncogénique.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO CXXC5 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène CXXC5 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du CXXC5, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert CXXC5 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine CXXC5.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en CXXC5 pour l'étude de la signalisation de CXXC5, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de CXXC5 essentiels à la fonction de CXXC5
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de CXXC5 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le CXXC5 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le CXXC5 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus CXXC5. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le CXXC5 plasmide HDR (h) et le CXXC5 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie CXXC5 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles CXXC5 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.