Plasmide CRISPR/Cas9 KO CXX1 (h): sc-406246

Présentation

FAM127A code la protéine humaine CXX1, un facteur encore mal caractérisé, impliqué dans des processus nucléaires et la régulation de l’état cellulaire. Les données disponibles suggèrent que CXX1 pourrait participer à des fonctions associées à la chromatine et au contrôle transcriptionnel, la reliant à des voies qui influencent la prolifération, les réponses au stress et les programmes de différenciation. Une expression altérée de FAM127A a été rapportée dans des jeux de données génomiques et transcriptomiques provenant de multiples contextes pathologiques, ce qui renforce son intérêt comme cible de recherche pour étudier les mécanismes de régulation génique et les phénotypes liés à la fitness cellulaire.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO CXX1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène FAM127A dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du FAM127A, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert FAM127A à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine CXX1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en FAM127A pour l'étude de la signalisation de CXX1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de FAM127A essentiels à la fonction de CXX1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de FAM127A pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le CXX1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le CXX1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus FAM127A. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le CXX1 plasmide HDR (h) et le CXX1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie FAM127A pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles FAM127A définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.