CHD6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-413570

Übersicht

CHD6 (Chromodomain-Helikase-DNA-bindendes Protein 6) ist ein ATP-abhängiger Chromatin-Remodeler aus der CHD-Familie, der die Erkennung von Histonmarkierungen mit der Neupositionierung von Nukleosomen koppelt, um Transkriptionsprogramme zu regulieren. Es trägt zur Chromatinorganisation und zu DNA-templatierten Prozessen bei, beeinflusst die RNA-Polymerase-II-abhängige Genexpression und die zellulären Stressantworten durch Modulation der Chromatinzugänglichkeit. Durch die Prägung epigenetischer Zustände wirkt CHD6 auf Signalwege ein, die Differenzierung, Proliferation und Genomstabilität steuern. Eine fehlregulierte Chromatin-Remodellierung unter Beteiligung von CHD6 wurde mit veränderten Transkriptionsnetzwerken in Krebs und anderen Erkrankungen mit epigenetischer Dysfunktion in Verbindung gebracht, was es zu einem nützlichen Ziel für mechanistische Studien macht.

Das CHD6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des CHD6-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des CHD6-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von CHD6 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die CHD6-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von CHD6-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der CHD6-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf CHD6-Exone abzielen, die für die CHD6-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere CHD6-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom CHD6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom CHD6 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des CHD6-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das CHD6 HDR-Plasmid (h) und CHD6 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von CHD6-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten CHD6-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.