CD9P-1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-404449

Descripción general

PTGFRN codifica CD9P-1 (también conocida como EWI-F), una proteína de la superfamilia de las inmunoglobulinas asociada a tetraspaninas que organiza microdominios de membrana mediante interacciones con CD9/CD81 y los conecta con el citoesqueleto de actina. CD9P-1 contribuye a la regulación de la adhesión celular, la migración y la señalización al coordinar complejos enriquecidos en integrinas y tetraspaninas en la membrana plasmática. Estos procesos se cruzan con vías que gobiernan la remodelación del citoesqueleto, la interacción con la matriz extracelular y el tráfico vesicular, que se examinan con frecuencia en estudios sobre comportamiento invasivo y remodelado tisular. Se han descrito alteraciones en la expresión de PTGFRN y perturbaciones en la red de CD9P-1 en múltiples contextos asociados a enfermedades, lo que impulsa la investigación mecanística en biología del cáncer e inmunofenotipos relacionados con la inflamación.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO CD9P-1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen PTGFRN en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del PTGFRN junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de PTGFRN tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína CD9P-1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en PTGFRN para la investigación de la señalización de CD9P-1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de PTGFRN críticos para la función de CD9P-1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de PTGFRN para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido CD9P-1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido CD9P-1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus PTGFRN. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR CD9P-1 (h) y el plásmido HDR CD9P-1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología PTGFRN para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana PTGFRN definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.