CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-420985
- Zielspezies: mouse
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- CD362/SDC2/Syndecan-2 Das CRISPR/Cas9-Knockout (KO)-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, von denen jedes für die Cas9-Nuklease und eine zielspezifische 20-nt-Guide-RNA (gRNA) kodiert, die für maximale Knockout-Effizienz unter Verwendung von Sequenzen aus der GeCKO v2-Bibliothek entwickelt wurde
- gRNA-Sequenzen lenken Cas9 so, dass es ortsspezifische Doppelstrangbrüche (DSBs) im CD362/SDC2/Syndecan-2-Genomlokus induziert, was zu einem Gen-Knockout durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ) führt
- Die Puromycin-Resistenz- und RFP-Gene werden von LoxP-Stellen flankiert, was die Entfernung der Selektionsmarker mittels Cre-Rekombinase (Cre-Vektor: sc-418923) nach der Etablierung stabiler Knockout-Zelllinien ermöglicht
- Nach der Transfektion kann die Effizienz des Gen-Knockouts per Western Blot oder histologisch mit folgendem Antikörper überprüft werden: CD362/SDC2/Syndecan-2: sc-376160
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) | sc-420985 | 20 µg | $397.00 |
Übersicht
Sdc2 kodiert Syndecan-2 (CD362/SDC2), ein transmembranäres Heparansulfat-Proteoglykan, das als Korezeptor für Komponenten der extrazellulären Matrix und heparinbindende Wachstumsfaktoren fungiert. Durch die Organisation von Ligandeninteraktionen an Zelloberflächen-Proteoglykanen reguliert SDC2 Zelladhäsion, Migration und Zytoskelettumbau und beeinflusst die Signalübertragung über Signalwege wie FGF, VEGF, Wnt sowie Integrin/FAK–SRC-Netzwerke. In Mausmodellen wird Sdc2 zur Untersuchung der stromal-epithelialen Kommunikation, angiogener Antworten und des Gewebeumbaus in Entwicklungs- und Verletzungsmodellen eingesetzt. Eine veränderte SDC2-Expression oder -Glykosylierung wird zudem im Kontext von Fibrose und der Biologie des Tumormikromilieus untersucht, wo matrixabhängige Signale Proliferation und Invasivität modulieren können.
Das CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Sdc2-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Sdc2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.
Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Sdc2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die CD362/SDC2/Syndecan-2-Proteinexpression aufheben.
Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Sdc2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der CD362/SDC2/Syndecan-2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.
Hauptmerkmale
- sgRNAs, die auf Sdc2-Exone abzielen, die für die CD362/SDC2/Syndecan-2-Funktion entscheidend sind
Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
Pool von Plasmiden, die auf mehrere Sdc2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion
Designvarianten
CRISPRs +/- HDRs
- gRNAs, die vom CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Sdc2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das CD362/SDC2/Syndecan-2 HDR-Plasmid (m) und CD362/SDC2/Syndecan-2 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Sdc2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Sdc2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.