ARID3A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404552

Übersicht

ARID3A (AT-reiche Interaktionsdomäne 3A) ist ein DNA-bindender Transkriptionsfaktor, der die Zugänglichkeit des Chromatins und linienspezifische Genexpressionsprogramme reguliert. In hämatopoetischen Systemen ist er eng mit der B‑Zell-Entwicklung und der Regulation von Immunglobulin-Genen verknüpft und in Transkriptionsnetzwerke eingebunden, die Differenzierung, Proliferation und Apoptose koordinieren. Die ARID3A-Aktivität beeinflusst die epigenetische Kontrolle von Ziel-Loci und kann zelluläre Reaktionen auf Entwicklungs- und Stresssignale mitsteuern. Eine fehlregulierte Expression oder Funktion von ARID3A wurde mit veränderten Immunzell-Phänotypen in Verbindung gebracht und in Kontexten wie hämatologischen Malignomen und Autoimmunität untersucht.

Das ARID3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des ARID3A-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des ARID3A-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von ARID3A nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die ARID3A-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von ARID3A-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der ARID3A-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf ARID3A-Exone abzielen, die für die ARID3A-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere ARID3A-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom ARID3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom ARID3A CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des ARID3A-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das ARID3A HDR-Plasmid (h) und ARID3A HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von ARID3A-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten ARID3A-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.