ZNF818阻害剤を設計するプロセスは、タンパク質の構造と機能の関係を包括的に調べることから始まる。構造生物学者は、高分解能イメージング技術を駆使して、ジンクフィンガードメイン内のアミノ酸の正確な配置を決定し、低分子の介入が可能な潜在的結合部位を特定する。X線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)分光法、クライオ電子顕微鏡などの技術が、タンパク質を原子レベルで可視化するために使われるかもしれない。この構造データをもとに、化学者と計算生物学者が協力して、ZNF818を特異的に標的とする分子を開発する。設計プロセスでは、分子ドッキングやバーチャルスクリーニングなどのコンピューター支援薬物設計(CADD)技術を活用して、阻害剤候補とZNF818タンパク質との相互作用を予測し、改良することになるだろう。目標は、ZNF818に対する親和性が高く、他のジンクフィンガータンパク質との交差反応性を避けるために特異性の高い分子を作り出すことであろう。
設計段階に続いて、合成された候補分子は、ZNF818に結合してその機能に影響を与える有効性を確認するために、厳密な生化学的特性評価を受ける。これらのアッセイでは、結合親和性、特異性、タンパク質の活性を変化させる阻害剤の能力を測定する。ジンクフィンガータンパク質は大規模で機能的に多様なファミリーであり、オフターゲット効果は複数の細胞経路を混乱させる可能性があるため、特異性の確保は極めて重要である。従って、ZNF818阻害剤の開発は、これらの分子の特異性と結合特性を磨くために、様々な誘導体を合成し、試験するという反復プロセスとなる。ZNF818阻害剤の創製は、構造生物学、合成化学、計算機モデリングの糸を紡ぎ合わせて精密な分子操作を達成するという、現代の創薬の複雑なダンスを象徴するものである。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $40.00 $82.00 $256.00 | 127 | |
この化合物は、タンパク質合成における転位ステップを阻害することによって真核生物のタンパク質合成を阻害し、ZNF818を含むタンパク質レベル全体を低下させる可能性がある。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
DNAにインターカレートしてRNAポリメラーゼを阻害することにより作用し、一般的に多くの遺伝子のmRNA合成を低下させるが、ZNF818もその可能性がある。 | ||||||
Rapamycin | 53123-88-9 | sc-3504 sc-3504A sc-3504B | 1 mg 5 mg 25 mg | $62.00 $155.00 $320.00 | 233 | |
mTORに特異的に結合し、その活性を阻害することで、タンパク質合成が減少し、ZNF818のようなタンパク質のレベルに影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
MG-132 [Z-Leu- Leu-Leu-CHO] | 133407-82-6 | sc-201270 sc-201270A sc-201270B | 5 mg 25 mg 100 mg | $56.00 $260.00 $980.00 | 163 | |
このプロテアソーム阻害剤はタンパク質の分解を防ぐことができ、ZNF818の発現を制御する転写因子のレベルや機能に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Camptothecin | 7689-03-4 | sc-200871 sc-200871A sc-200871B | 50 mg 250 mg 100 mg | $57.00 $182.00 $92.00 | 21 | |
DNAトポイソメラーゼIの阻害剤であり、DNA損傷を引き起こし、ZNF818を含む様々な遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Fluorouracil | 51-21-8 | sc-29060 sc-29060A | 1 g 5 g | $36.00 $149.00 | 11 | |
チミジル酸合成酵素を阻害し、DNA合成を阻害するピリミジンアナログで、遺伝子発現に広く影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
緑茶に含まれるこのポリフェノールは遺伝子発現を調節することが示されており、間接的にZNF818の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Retinoic Acid, all trans | 302-79-4 | sc-200898 sc-200898A sc-200898B sc-200898C | 500 mg 5 g 10 g 100 g | $65.00 $319.00 $575.00 $998.00 | 28 | |
核内受容体を介して遺伝子発現を調節することにより、レチノイン酸はZNF818の発現に間接的な影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Hydroxyurea | 127-07-1 | sc-29061 sc-29061A | 5 g 25 g | $76.00 $255.00 | 18 | |
リボヌクレオチド還元酵素を阻害し、DNA合成の減少をもたらし、遺伝子発現に広く影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
SP600125 | 129-56-6 | sc-200635 sc-200635A | 10 mg 50 mg | $40.00 $150.00 | 257 | |
ZNF818を含む遺伝子発現プロファイルに影響を与える可能性のあるJNKシグナル伝達阻害剤である。 | ||||||