ZNF6活性化物質には、アデニル酸シクラーゼを刺激する化合物やβアドレナリン作動薬として作用し、細胞内のcAMPレベルを上昇させる化合物が含まれる。このcAMPの上昇は、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、このPKAは、ZNF6と相互作用し、その機能的活性を高める可能性のある転写因子を含む様々な基質をリン酸化する。同様に、ある種のジアシルグリセロール類似体によってプロテインキナーゼC(PKC)が活性化されると、ZNF6を含む標的タンパク質がリン酸化され、転写調節におけるZNF6の役割が増強される可能性がある。さらに、カルシウムイオンと複合体を形成するか、カルシウムイオノフォアとして作用することにより、細胞内カルシウム濃度を上昇させる薬剤は、カルシウム依存性プロテインキナーゼを活性化する事象のカスケードを開始する可能性がある。これらのキナーゼはZNF6をリン酸化し、機能的活性を増加させる可能性があり、ZNF6の活性が調節されうる別のメカニズムを示している。
ZNF6活性化の他のメカニズムとしては、クロマチン構造の変化やDNAメチル化による遺伝子発現の調節がある。ヒストン脱アセチル化酵素やDNAメチル化酵素を阻害する化合物は、それぞれ、より緩和なクロマチン状態や遺伝子プロモーターの低メチル化をもたらし、その結果、ZNF6遺伝子の転写が促進される可能性がある。さらに、グリコーゲン合成酵素キナーゼ-3の阻害や、成長因子シグナル伝達によるMAPK/ERK経路の活性化は、ZNF6の発現を増加させる転写因子を安定化させ、活性化させる可能性がある。
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