Trak1の化学的活性化剤は、その活性に影響を与えるために様々な細胞内メカニズムを利用する。プロテインキナーゼC(PKC)の特異的阻害剤であるBisindolylmaleimide Iは、PKCを介したリン酸化を減少させることにより間接的にTrak1を活性化し、Trak1がミトコンドリア輸送における役割に適した活性状態を維持することを可能にする。フォルスコリンは、アデニル酸シクラーゼの活性化を通じてcAMPレベルの上昇をもたらし、その結果、プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。活性化されたPKAはTrak1をリン酸化し、モータータンパク質との相互作用を強化し、その結果、輸送機能を高める。同様に、cAMPアナログであるジブチリル-cAMPもPKAを活性化し、Trak1をリン酸化して活性化し、細胞内輸送過程におけるTrak1の役割を促進する。
イオノマイシンは細胞内カルシウムを上昇させ、カルシウム/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼ(CaMK)を活性化し、Trak1をリン酸化し、軸索輸送に関する活性を促進する。フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)はPKCを直接刺激し、Trak1をリン酸化して活性化し、ミトコンドリア輸送を促進する。タンパク質リン酸化酵素PP1とPP2Aの阻害剤であるオカダ酸とカリクリンAは、タンパク質のリン酸化を全体的に増加させ、Trak1に影響を与え、オルガネラ輸送におけるその役割を調節する可能性がある。JNKを活性化するアニソマイシンは、Trak1をリン酸化し、細胞ストレス応答時の機能に影響を及ぼす可能性がある。エピガロカテキンガレート(EGCG)は、ホスホジエステラーゼを阻害してcAMPの上昇を引き起こし、その後PKAを活性化し、Trak1のリン酸化と活性化につながる。Chelerythrineは、PKCを阻害することにより、Trak1を活性化しうるリン酸化パターンを変化させる。最後に、ノノ酸スペルミンは一酸化窒素を放出し、グアニリルシクラーゼを活性化し、cGMPレベルを上昇させ、Trak1をリン酸化するもう一つのキナーゼであるPKGを活性化し、その活性に影響を与える。
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