転写の開始と伸長のプロセスは、タンパク質、補因子、化学的調節因子の複雑な相互作用に依存している。TFIIDのスモールサブユニットであるTAF9は、RNAポリメラーゼIIに基づく転写を可能にするために他の転写因子と結合し、この文脈で重要な役割を果たしている。TAF9の活性に直接的または間接的に影響を与える様々な化学物質が同定されている。その作用機序は、多くの場合、ヒストン修飾のようなエピジェネティックなマーカーの調節を中心に展開する。例えば、ヒストンのアセチル化とメチル化は遺伝子発現の重要な決定因子であり、DNA鋳型の転写機構へのアクセシビリティに影響を与える。前者はヒストン脱アセチル化酵素を阻害してヒストンアセチル化を促進し、後者はDNAメチル化を阻害する。
これらの活性化因子が作用するもう一つの方法は、転写開始に間接的に関係する主要なキナーゼやタンパク質を調節することである。例えば、RNAポリメラーゼIIのリン酸化を阻害する化合物であるDRBは、プレイニシエーション複合体のアセンブリと機能に影響を与える可能性がある。同様に、ラフキナーゼであるZM 336372は、MAPK経路を調節することによって、転写制御に下流から影響を及ぼす可能性がある。さらに、BIOのような化学物質は、GSK-3のようなキナーゼを特異的に標的とし、これらのキナーゼは転写を含む多様な細胞内プロセスに関与している。このようなキナーゼを阻害することで、これらの化学物質は、TAF9のような転写因子のイニシエーション過程での作用を助長する細胞環境を作り出すことができる。選ばれた化学物質は、転写制御の複雑さについての洞察を提供し、これらのプロセスの理解を深める上で、化学修飾剤の重要性を強調している。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $152.00 $479.00 $632.00 $1223.00 $2132.00 | 33 | |
ヒストンの過剰アセチル化を促進するヒストン脱アセチル化酵素阻害剤で、TFIIDのプロモーター領域への結合親和性を高め、間接的にTAF9の機能をアップレギュレートする。 | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
DNAメチル化酵素阻害剤であり、遺伝子サイレンシングを抑制し、TAF9や他の転写因子の機能を促進する。 | ||||||
Anacardic Acid | 16611-84-0 | sc-202463 sc-202463A | 5 mg 25 mg | $102.00 $204.00 | 13 | |
ヒストンアセチルトランスフェラーゼ阻害剤。ヒストンのアセチル化を調節することで、転写開始におけるTAF9の役割に間接的に影響を与えることができる。 | ||||||
C646 | 328968-36-1 | sc-364452 sc-364452A | 10 mg 50 mg | $265.00 $944.00 | 5 | |
ヒストンアセチルトランスフェラーゼp300を特異的に阻害し、クロマチン構造を変化させ、TAF9とTFIID複合体との会合を促進する可能性がある。 | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $43.00 $189.00 $316.00 $663.00 | 6 | |
RNAポリメラーゼIIのCTDリン酸化を阻害し、TAF9が関与するプレイニシエーション複合体形成を促進する可能性がある。 | ||||||
ZM 336372 | 208260-29-1 | sc-202857 | 1 mg | $47.00 | 2 | |
下流のMAPK経路を間接的に調節するRafキナーゼ阻害剤。これは転写調節因子の動態を変化させ、TAF9に影響を与える可能性がある。 | ||||||
GSK-3 Inhibitor IX | 667463-62-9 | sc-202634 sc-202634A sc-202634B | 1 mg 10 mg 50 mg | $58.00 $188.00 $884.00 | 10 | |
GSK-3阻害剤は、転写活性を調節し、TFIID複合体内のTAF9の機能を間接的に調節することができる。 | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $133.00 $275.00 | 37 | |
ヒストンのアセチル化を促進し、TAF9と転写複合体との相互作用を促進する可能性のあるヒストン脱アセチル化酵素阻害剤。 | ||||||
BIX01294 hydrochloride | 1392399-03-9 | sc-293525 sc-293525A sc-293525B | 1 mg 5 mg 25 mg | $37.00 $112.00 $408.00 | ||
G9aヒストンメチル化酵素阻害剤。ヒストンのメチル化に影響を与えることで、転写開始におけるTAF9の役割に影響を与える可能性がある。 | ||||||
PFI-1 | 1403764-72-6 | sc-478504 | 5 mg | $98.00 | ||
BETブロモドメイン阻害剤。ブロモドメインの相互作用を修飾することで、TAF9を含むTFIID構成因子に間接的に影響を与える。 | ||||||