Scotinの化学的阻害剤は、小胞体(ER)ストレスを誘発し、Scotin活性を変化させる様々なメカニズムによって阻害効果を発揮する。ブレフェルジンAは、ADPリボシル化因子を阻害することにより小胞体輸送を阻害し、小胞体ストレスを引き起こし、スコチンを通常の制御的役割ではなくアポトーシスに関与させる。同様に、タプシガルギンとシクロピアゾン酸は、小胞体/小胞体Ca2+ ATPase (SERCA)を阻害し、小胞体カルシウム貯蔵量を枯渇させ、小胞体ストレスを誘発することで、スコチンの活性をその典型的な機能からストレスによって誘導されたミスフォールドタンパク質の処理へとシフトさせる。ツニカマイシンは、タンパク質の適切なフォールディングに必要なプロセスであるN-結合型グリコシル化を阻害し、その結果、小胞体内にミスフォールディングタンパク質が蓄積し、異常なタンパク質応答活性に関与するようになり、スコチンの通常の機能を損なう可能性がある。
さらに、SalubrinalとGuanabenzは、eIF2αの脱リン酸化を選択的に阻害することにより、折りたたまれないタンパク質応答を増加させ、その機能をミスフォールドタンパク質の管理に固定することにより、Scotinを阻害する可能性がある。プロテアソーム阻害剤であるMG-132は、ポリユビキチン化タンパク質の蓄積を引き起こし、小胞体ストレスを引き起こし、スコティンの機能をプロテオスタシス維持に向かわせる。エヤレスタチンIは、小胞体関連分解(ERAD)を直接阻害し、小胞体内にミスフォールディングタンパク質を蓄積させ、小胞体ストレス応答に関与させることによってスコチンを阻害する。解糖を阻害する2-デオキシ-D-グルコースの作用も、エネルギー枯渇による小胞体ストレスにつながり、スコチンをストレス応答に関与させる。アゾラミドは、ERのフォールディング能力を高めることにより、スコチンのアンフォールデッドタンパク質応答への関与を減らし、それによってスコチンの通常の活性を阻害することができる。ISRIBはeIF2αのリン酸化の影響を逆転させ、GSK2606414はPERKの阻害を通じて、小胞体ストレス応答へのスコチンの関与を阻止することができる。これにより、スコチンの通常の細胞機能は維持されるが、スコチンが通常反応するはずのストレスシグナルがないため、活性レベルは低下する。
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