そのようなカテゴリーが存在するとすれば、概念的には、RBM32Aというタンパク質の活性を特異的に増加させる分子で構成されるだろう。RBM32Aが活性化されうるタンパク質であると仮定すると、これらの活性化因子はおそらく、その生物学的活性を促進するために重要な部位でタンパク質と相互作用するであろう。この部位は、RBM32Aの触媒機構に直接関連する可能性もあるし、活性化因子が二次的な部位に結合し、活性の増加をもたらす構造変化を引き起こすような、アロステリックな調節を伴う可能性もある。このクラスの化学構造は非常に多様であり、有機低分子、ペプチド、あるいはRBM32Aの構造輪郭に適合するように、また他の細胞成分に影響を与えることなくその機能を正確に調節するように作られた他の特殊な化合物も含まれる可能性がある。
RBM32Aアクチベーターの発見と改良は、RBM32Aタンパク質の構造と機能の詳細な調査から始まる複雑なプロセスであろう。X線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡、NMR分光法などの構造決定法は、RBM32Aの三次元配置、特に活性部位や結合部位を明らかにするために極めて重要である。この構造的青写真は、RBM32Aと相互作用し、その活性化を促進しそうな分子の設計と合成の指針となるだろう。分子モデリングとバーチャルスクリーニングによって、潜在的な活性化因子がRBM32Aとどのように相互作用するかを予測する。これらの予測は、候補分子の存在下でのRBM32A活性の変化を測定することを目的とした経験的生化学的アッセイによって検証されるであろう。最初のスクリーニングによって、活性化剤の可能性を持つリード化合物が同定され、その後、化学的最適化が行われる。このプロセスでは、構造活性相関(SAR)アプローチを採用し、リード化合物を修飾して特異性、効力、安定性を高める。この反復サイクルの中で、RBM32Aと相互作用するように微調整された一連の化合物が開発され、その結果、生物学的背景におけるタンパク質の機能と作用機序についての洞察が得られるであろう。
関連項目
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製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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Pladienolide B | 445493-23-2 | sc-391691 sc-391691B sc-391691A sc-391691C sc-391691D sc-391691E | 0.5 mg 10 mg 20 mg 50 mg 100 mg 5 mg | $290.00 $5572.00 $10815.00 $25000.00 $65000.00 $2781.00 | 63 | |
スプライシング阻害剤として、RNA結合タンパク質を含むスプライシングに関連する遺伝子の発現を調節する可能性がある。 | ||||||
Etoposide (VP-16) | 33419-42-0 | sc-3512B sc-3512 sc-3512A | 10 mg 100 mg 500 mg | $32.00 $170.00 $385.00 | 63 | |
DNA損傷を引き起こす化学療法剤で、RBMタンパク質を含むDNA損傷応答に関与する遺伝子の発現を変化させる可能性がある。 | ||||||
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
DNAにインターカレートして転写を阻害し、RNA結合タンパク質の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Leptomycin B | 87081-35-4 | sc-358688 sc-358688A sc-358688B | 50 µg 500 µg 2.5 mg | $105.00 $408.00 $1224.00 | 35 | |
この化合物は核外輸送を阻害するため、RNA結合タンパク質が核内に蓄積し、その発現レベルに影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Suberoylanilide Hydroxamic Acid | 149647-78-9 | sc-220139 sc-220139A | 100 mg 500 mg | $130.00 $270.00 | 37 | |
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、クロマチン構造を変化させ、RNA結合タンパク質を含む様々な遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
エピジェネティックなサイレンシングを逆転させることにより遺伝子をアップレギュレートする可能性のあるDNA脱メチル化剤で、RNA結合タンパク質を含む可能性がある。 | ||||||
Puromycin | 53-79-2 | sc-205821 sc-205821A | 10 mg 25 mg | $163.00 $316.00 | 436 | |
この抗生物質は翻訳中に早期の鎖終結を引き起こし、その存在は遺伝子発現に影響を及ぼす可能性のある細胞ストレスを誘発する。 | ||||||
Staurosporine | 62996-74-1 | sc-3510 sc-3510A sc-3510B | 100 µg 1 mg 5 mg | $82.00 $150.00 $388.00 | 113 | |
強力なキナーゼ阻害剤であり、アポトーシスを誘発し、ストレス応答を受けている細胞の遺伝子発現プロファイルに影響を与えることができる。 | ||||||
Sodium (meta)arsenite | 7784-46-5 | sc-250986 sc-250986A | 100 g 1 kg | $106.00 $765.00 | 3 | |
この化合物は酸化ストレスを誘導し、おそらくRNA結合タンパク質を含むストレス応答に関連する遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $40.00 $82.00 $256.00 | 127 | |
真核生物のタンパク質合成を阻害し、ストレスを引き起こす可能性があり、mRNAプロセシングに関与するタンパクの発現を変化させる可能性がある。 |